越来越大欧美国家 人民可能生活 综合水平 而大幅综合水平 ,广大民众对医疗保健的不能更多需求随着 越来越大增长,毕竟为各种技术创新、跨界紧密结合其他这也商业模式一创新提供更多了源源越来越大新的内容动力。基因整体性 行业在毕竟会的 当今时代而大背景下应运而生,毕竟会毕竟 在产前检测、肿瘤检测、药物研发等精准医疗相关领域发挥着重巨大作用明显。
基因各种技术被觉得 是转变 未来十年的各种技术他成 ,这就开启你的生命数字化的基石。才是两个基础毕竟,拥有独特前瞻性的公司目前在探索你的生命数字化,用个体化的基因综合数据去精准掌握个体健康完美状态 ,制定干预措施,指导个体保持稳定良恰当健康完美状态 。
华大基因这就三个的公司目前。华大集团宣布成立于1999年,是国内外领先的你的生命科学前沿机构。秉承“基因科技造福人类意识”的使命,怀抱“健康美丽,做你的生命当今时代的引领者”的愿景,华大集团以“产学研”一体化的越来越大发展模式一引领基因组学的创新越来越大发展。
基因测序是测序仪将不可视化的生物其它信息转换为可视化的文本其它信息,依托计算、存储和及网络等IT资源,多种渠道生物其它信息算法对文本其它信息实施预测和专门研究 。等到三个强有力的IT两个基础设施必不可少。华大基因与华为云实施积极首次合作,顺利成功完成上云,成功完就成自动化测序预测决策强悍 。
云端基因测序
越来越大你的生命科学各种技术的越来越大发展,基因测序也呈现了新的内容越来越大发展特征。譬如基本标准化,基因测序也可确保其几经波折 呢的严谨和可重复;整体性 行业规模化,基因测序各种技术已广泛应用于医疗、农业、食品等多个相关领域,未来十年将呈现井喷式增长;平台提供化,测序公司目前譬如面向科研单位工作、制药公司目前和医疗机构提供更多感受体验 服务外,还可为保险、农业、IT等多个整体性 行业提供更多增值感受体验 服务;亲民化,测序各种技术越来越大更迭,成本呈现超摩尔定律的下降,从“天价”下降至千多美元,寻常商家均可充分享受各种技术红利。毕竟毕竟会的 转变 也给基因公司目前的IT建设中会带回来了相而巨大挑战。
譬如该如何在高峰快速响应几经波折 呢新客户?测序业务通常为部分项目型,有较为明显淡季和旺季之分,旺季业务量毕竟会是淡季的10倍至少,本地资源不足以支撑峰值资源不能更多需求。
该如何轻资产运营?按全年均值/峰值配置IT资源,二次性投入大、固定资产投入高、总成本高、建设中周期长且再次出现资源闲置,不容易再次出现资金多链断链不会不会产生公司目前整体性 运营,且3-5年后老旧设备需更新换代。
该如何大幅综合水平 解读效率?大其它剩余 业务软件程序 开源,软件程序 运行实践中所中未匹配恰当的IT资源,致使不尽相同业务流的资源负载不均衡,几经波折 呢致使IT资源浪费、切实有效多种渠道率低下,不会产生不会不会产生整体性 成本竞争力,如30X的WGS测序耗时从6小时到40小时不等,测序预测耗时长。
该如何快速共享、可靠存储和挖掘综合数据潜在其价值?基因测序其它剩余 业务依赖一定量样本综合数据,综合数据实践中所所中需存储设备高可靠,且是一定量间很长内数以万计据访问不能更多需求,毕竟会综合数据的存储成本和管理成本越来越大凸显,综合数据存储的投入产出相对低。
从至少挑战,广大民众自己也可我看到采用基本标准云的IT资源交付形式毕竟基因公司目前相公认 可谓是“雪中送炭”。基因测序分为综合数据收集、测序预测(基因转换、基因拼接、基因比对、基因注释)、综合数据交付(综合数据归档/分发)等实践中毕竟IT资源规格的不能更多需求这就多样化,通常实践中注重算力预测,通常实践中注重可靠存储。
其他这也这也,基因公司目前了不尽不尽相同越来越大发展实践中也对IT架构拥有独特不尽不尽相不尽相同不能更多需求,起步实践中是单点感受体验 服务器,企业中成短期内 是集群部署,目前市场业务扩张期便是本地集群与云的混合部署。他成 三个新的内容整体性 行业,基因测序的IT人员匮乏,专业方向上毕竟会的人做专业方向上事是,IT建设中毕竟交给专业方向上毕竟会的人负责。
在基因测序的流实践中,也可强悍的算力鼓励。从某种意义上说,你的生命科学的专门研究 竞赛,毕竟会的 等到毕竟 他成 我十场算力的比拼。基因测序对算力的不能更多需求这就波动的,其他这也这也毕竟不尽不尽相同生物的基因组,也可的算力根本不 同,毕竟会牵扯到计算集群的扩缩容,但采用传统的线下计算集群难于成功完成快速扩缩容,毕竟凸显了云计算的便利性。总之,业务上云毕竟 他成 当下基因公司目前的拥有再选择。
确定到华大基因,曩昔计算资源相对紧张,在实施峰值时,任务安排常常也可排队等候;其他这也这也科技感受体验 服务有毕竟会的 复杂基因组,新客户也可多种渠道不尽不尽相同规格的计算资源,广大民众自己云计算提供更多的灵活性最完美恰当再选择。经近选型,华大基因几经波折 呢选了华为云。
华大基因牵手华为云
2018年,华为云国内外首家即将推出来以Kubernetes为两个基础的基因容器感受体验 服务GCS,两个基础轻量级的容器各种技术,紧密结合大综合数据、深度认真学习算法,为测序厂商提供更多了灵活可定制的测序流程、秒级可伸缩的高可靠资源和便捷一站式现有商家感受体验 ,让基因测序综合数据的计算更省、更快、更轻松。
多种渠道GCS,华大基因打通了上云流程。到目前华为云与华大基因成功完成至少300万核时计算,平稳运行至少100天,成功完就成人文环境 快速部署;按需实施,应对业务波动;高并发,2万核资源池;弹性释放,节约30%成本;保留现有商家习惯,兼容SGE命令行。
GCS感受体验 服务为华大基因提供更多了全自动化测序预测决策强悍 ,实施生物其它信息流剩余采用基本标准器,再复杂的业务也也可编排到三个流实践中,一键搞定测序任务安排;实施国内外生信人剩余采用基本标准的流程整体性 控制语法,结构简练、易懂,既不不能更多需求了流程编写的易用性,其他这也这也也确保了流程迁移的方便性;流程热力图提供更多相对直观的多种渠道,随时全面了解测序进展,精确掌握资源消耗走势,指导优化方向上;鼓励前提条件判断,可遵循上述判断前提条件,再选择执行分支,不不能更多需求企业中复杂流程的管理的也可。
华为云基因测序解决好方案提供更多完整的测序流程细粒度管理决策强悍 ,其他这也这也提供更多云上云决策强悍 ,便于现有商家定制相关领域云平台提供。其他这也这也,还提供更多业界主流第三方引擎编排决策强悍 ,如Cromwell、SGE等。
华为云基因测序解决好方案架构/新闻来源:华为云官网
确定到基因测序,在综合数据收集实践中,华为云基因测序解决好方案提供更多多通道成功完成本地-云和云-云相互之间之间综合数据交互,成功完成低成本、高可靠、一站式传输、多级防护、访问隔离。华为云提供更多云专线(DC)、综合数据快递感受体验 服务(DES)、对象存储迁移感受体验 服务(OMS)和云迁移感受体验 服务(CDM)等多种传输感受体验 服务,可成功完成本地机房-公有云和公有云-公有云的综合数据交互,其他这也这也提供更多API、SDK和第三方工具等帮组业务人员位置设置存储空间提升访问策略、MD5一致性校验和账户管理等,确保交互实践中所安全可靠、十分简单易用和综合数据一致。
在测序预测实践中,华为云基因测序解决好方案公有云HPC可无缝移植本地IDC架构,提供更多高性能计算实例、简化存储流程。华为云提供更多了提供更多C3(通用计算大幅综合水平 型)、M2(内存优化型)、H1(高计算型Ⅰ代采用基本标准10GE及网络)、H2(超高计算型Ⅱ代采用基本标准100G InfiniBand及网络)高计算型等规格的ECS计算实例,匹配不尽不尽相不尽相同测序预测流程对计算和存储的配比不能更多需求;遵循上述专属物理感受体验 服务器多种渠道提供更多卓越的计算性能,无虚拟化损耗,拥有独特良恰当性能明显优势,现有商家可实施管理整体性 控制台成功完成裸金属感受体验 服务器的自动化发放,不不能更多需求组装/拼接业务而大内存节点的不能更多需求。
其他这也这也,GCS(基因容器感受体验 服务)提供更多一键式生信预测平台提供,鼓励多资源混合调度、十分简单易用、精细化整体性 控制资源多种渠道率。云容器引擎(CCE)和云容器实例(CCI)鼓励多种资源(计算、存储和第三方软件程序 )混合调度,帮组业务全流程容器化改造,其他这也这也可精细化整体性 控制资源多种渠道率我一键重现从历史预测流程
GCS还提供更多私有云版本,线下成功完成其它剩余 线上其它功能,线上线下其它功能和人文环境 一致,现有商家实施习惯一致;天然打通线上线下不会产生容器混合云,容器镜像自动同步,资源、应用统一管理运维;单集群超大规模,不不能更多需求新客户超大规模综合数据四大中心诉求;独立解耦,不绑定底层两个基础设施,广泛鼓励各类虚拟化方案:VMware、OpenS tack、FusionSphere等;鼓励独立的租户运行系统,并可与新客户租户运行系统对接;3种容器及网络方案:Overlay L2,Underlay OVS,Underlay IPVLan,其他这也这也兼容Calico,全面覆盖各类容器及网络场景;全面的运维体系,监控、日志持久化存储,告警对接现有商家告警运行系统(SMTP、SMS),7乘24小时专业方向上运维鼓励。
在综合数据交付实践中,华为云基因测序解决好方案提供更多快速交付高速通道,简化各种操作,安全可靠。华为云提供更多云硬盘(EVS)、弹性文件感受体验 服务(SFS)和对象存储感受体验 服务(OBS)等多种类型的云存储感受体验 服务,实施多级可靠性架构,确保综合数据持久性少于99.9999999999%(12个9),业务再次性少于99.995%,并且 对象存储提供更多基本标准、低频和归档类型,存储成本最低可达0.033元/GB/月。
仍会再次赋能整体性 行业
如上所述,华为云基因测序解决好方案提供更多了基本标准架构与仍会再次创新,提供更多基本标准的高性能计算架构,不不能更多需求本地机房与公有云无缝对接的不能更多需求,其他这也这也推我一键式生信预测平台提供帮组快速部署生信流程,大幅综合水平 测序预测效率而大幅综合水平 综合成本
越来越大赋能生信企业中拓展高附加值业务。并且 大综合数据决策强悍 ,实施计算存储分离、内存及分布式缓存、智能调度,大综合数据性能大幅综合水平 40%,成本大幅综合水平 50%;人工智能决策强悍 ,实施作业群组管理、拓扑感知的亲和性调度,GPU线性加速比大幅综合水平 35%,大幅综合水平 人工智能50%训练时间很长;鲲鹏算力,整型计算+多核契合测序预测,Minimap2软件程序 在鲲鹏920下性价比领先同代x86处理过程器20%。
才是三个的整体性 实力,华为云越来越大赋能整体性 行业。譬如武汉衷心希望组&未来十年组联手华为,大幅综合水平 基因测序效率。武汉未来十年组采用基本标准Kunlun超大内存裸金属感受体验 服务器,承载重楼百合150G基因组装;打通线下综合数据生产平台提供与云端高性能计算平台提供相互之间之相互之间之间及网络链路,并能 线下不会产生的综合数据也可快速上传到云端,不会产生实施后续的预测。综合数据至少云端后,遵循上述部分项目不能更多需求,在整体性 控制台申请足够规模的弹性云计算资源,快速成功完成部分项目。
在医疗健康整体性 行业越来越大升级而大背景下,基因测序也可紧密结合更有好各种技术形式来至少更高的精准度和科学性,华为云基因测序解决好方案释放云+AI+5G的强悍动能,帮组生信企业中降本增效,成功完成整体性 行业的智能化越来越大升级。